Modelo revolucionará o cultivo da batata

O Consórcio de Seqüenciamento do Genoma da batata (PGSC), um grupo internacional de cientistas, anunciou a divulgação inicial da seqüência genômica da batata. O PGSC começou a trabalhar no projeto há três anos. O modelo resultante pode ser capaz de revolucionar os programas de geração desse tubérculo, que representa a  terceira cultura mais importante do planeta.

A batata, um dos principais membros da família Solanaceae, é um parente próximo do tomate, do pimentão e da berinjela. Evidências arqueológicas comprovam que o vegetal já é cultivado há 7.000 anos para efeitos de alimentação humana. Recentes pesquisas envolvendo estudos do material genético demonstraram que todas as variedades descendem de uma única cultivar originária do sul do Peru.   

Antecipar o acesso à seqüência de genes da batata, ou seja, ao seu “modelo genético" de como essa cresce e se reproduz, tem como objetivo impulsionar os cientistas de todo o mundo na melhoria de diversos parâmetros do tubérculo: rendimento, qualidade, valor nutricional e de resistência a doenças. Mais importante, o conhecimento genômico permitirá aos cultivadores uma redução do período de 10-12 anos necessários para a produção de novas variedades.

O PGSC foi iniciado em janeiro de 2006 pelo Departamento de Melhoramento Genético da Universidade e Centro de Pesquisa Wageningen, na Holanda. Posteriormente, tornou-se um consórcio internacional de grupos científicos de 14 países, incluindo o Brasil.

A batata apresenta um genoma de 12 cromossomos com estimativa de 840 milhões de pares de bases. No início do projeto, o PGSC empregou uma abordagem em que o trabalho estava alocado a cada membro baseado em cromossomos e centrado na linha diplóide RH89-039-16 (RH) de batata cultivada, Solanum tuberosum. No entanto, nos últimos dois anos, com o desenvolvimento significativo de uma nova geração tecnólogica de sequênciadores, modificações no projeto foram consideradas.

Em 2008, o seqüenciamento do duplo monoplóide DM1-3 516R44 (DM), derivado de uma variedade local diplóide de Solanum tuberosum, foi iniciado como um programa complementar ao seqüenciamento de RH. Em Junho de 2009, os membros do PGSC reuniram-se em Carlow, na Irlanda, para planejar as fases finais da pesquisa.

No momento corrente, o PGSC encontra-se centrado na finalização dos dados, tanto para DM quanto para RH. O programa assume como objetivo final apresentar um rascunho de alta qualidade da seqüência de ambas as linhas de batata até o final desse ano. Atualmente,  a cobertura genômica é maior do que 70 vezes (X) e faz uso de uma combinação de dados gerados em três plataformas de seqüenciamento diferenciadas, incluindo duas que pertencem a próxima geração de sequenciadores (NGS).

A montagem, que abrange 95% dos genes em batatas, foi somente possível devido a um algoritmo recentemente desenvolvido por um dos membros do PGSC na China, o Instituto de Genômica de Pequim. O resultado encontra-se agora disponível ao domínio público e as atualizações serão feitas durante os próximos 6 meses, à medida que dados adicionais sejam gerados, incluindo a anotação dos genes, a identificação do transcriptoma e a análise dos genes críticos para a produção da leguminosa.

Pela capacidade de produzir maior quantidade de alimento utilizando menos terra que qualquer outro cultivo, a batata assume o status de ser uma solução viável para reduzir a fome e a pobreza extrema no mundo.

01/10/2009